پونیو روی صخره‌ای کنار دریا

پسربچه‌ای به نام «سوسوکه» یک ماهی قرمز به نام «پونیو» را نجات می‌دهد و آن‌ها پیش از آنکه پدر پونیو — که جادوگری قدرتمند است — او را مجبور به بازگشت به خانه‌اش در اعماق دریا کند، سفری شگفت‌انگیز را در مسیر دوستی و کشف دنیای پیرامون آغاز می‌کنند. اما اشتیاق پونیو برای تبدیل شدن به یک انسان، تعادل ظریف طبیعت را برهم می‌زند و طوفانی عظیم به پا می‌کند. تنها مادر پونیو — که الهه زیبای دریاست — می‌تواند تعادل طبیعت را بازگرداند و رویاهای پونیو را محقق سازد.